豬丁型冠狀病毒CH/GX/1468B/2017的分離鑒定及全基因組序列分析
摘要：本研究于廣西某豬場采集疑似感染豬丁型冠狀病毒(porcine deltacoronavirus,PDCoV)的腹瀉仔豬小腸及其內(nèi)容物進行病毒分離,并通過細胞病變(CPE)、RT-PCR、間接免疫熒光(IFA)和全基因序列測定分析對分離的病毒進行鑒定。結(jié)果顯示,試驗成功分離到1株P(guān)DCoV,命名為CH/GX/1468B/2017(簡稱PDCoV 1468B)。該毒株可穩(wěn)定有效地在LLC-PK細胞生長增殖,并引起典型CPE;該毒株已在LLC-PK細胞連續(xù)傳代15代,病毒滴度隨著傳代次數(shù)的增加逐漸提高并穩(wěn)定在108.10TCID50/mL以上。該毒株全基因組序列長25 399 nt;與23個GenBank中登錄的參考毒株的全基因組序列比對顯示,核苷酸同源性為97.2%~99.4%,其中PDCoV 1468B分離毒株與Vietnam/Binh21/2015株同源性最高,為99.4%。全基因組系統(tǒng)進化分析顯示,PDCoV 1468B分離毒株屬于Ⅱ群,與東南亞國家PDCoV毒株親緣關(guān)系密切,處于同一進化分支。綜上所述,本研究成功分離出PDCoV 1468B株并進行了全基因序列分析,為進一步開展PDCoV致病性等生物學(xué)特性研究及疫苗研制奠定了基礎(chǔ),同時可為PDCoV的遺傳進化提供數(shù)據(jù)支持。
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中國畜牧獸醫(yī)雜志
中國畜牧獸醫(yī)雜志， 月刊，本刊重視學(xué)術(shù)導(dǎo)向，堅持科學(xué)性、學(xué)術(shù)性、先進性、創(chuàng)新性，刊載內(nèi)容涉及的欄目：生物技術(shù)、生理生化、動物營養(yǎng)與飼料科學(xué)、遺傳繁育、預(yù)防獸醫(yī)、基礎(chǔ)獸醫(yī)等。于1974年經(jīng)新聞總署批準的正規(guī)刊物。
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